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Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste.
Data corrente:  26/07/2022
Data da última atualização:  10/11/2022
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  CARDOSO, T. F.; BRUSCADIN, J. J.; AFONSO, J.; PETRINI, J.; ANDRADE, B. G. N.; OLIVEIRA, P. S. N. de; MALHEIROS, J. M.; ROCHA, M. I. P.; ZERLOTINI NETO, A.; FERRAZ, J. B. S.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.
Afiliação:  UFSCar; ESALQ/USP; Munster Technological University; UFSCar; Federal University of Latin American Integration, Foz do Iguaçu; UFSCar; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; FZEA/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE.
Título:  EEF1A1 transcription cofactor gene polymorphism is associated with muscle gene expression and residual feed intake in Nelore cattle.
Ano de publicação:  2022
Fonte/Imprenta:  Mammalian Genome, v. 33, n. 4, p. 619-628, Dec. 2022.
DOI:  https://doi.org/10.1007/s00335-022-09959-8
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Abstract. Cis-acting effects of noncoding variants on gene expression and regulatory molecules constitute a significant factor for phenotypic variation in complex traits. To provide new insights into the impacts of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) on transcription factors (TFs) and transcription cofactors (TcoF) coding genes, we carried out a multi-omic analysis to identify cis-regulatory effects of SNPs on these genes? expression in muscle and describe their association with feed efficiency-related traits in Nelore cattle. As a result, we identified one SNP, the rs137256008C > T, predicted to impact the EEF1A1 gene expression (? = 3.02; P-value = 3.51E-03) and the residual feed intake trait (? = -3.47; P-value = 0.02). This SNP was predicted to modify transcription factor sites and overlaps with several QTL for feed efficiency traits. In addition, coexpression network analyses showed that animals containing the T allele of the rs137256008 SNP may be triggering changes in the gene network. Therefore, our analyses reinforce and contribute to a better understanding of the biological mechanisms underlying gene expression control of feed efficiency traits in bovines. The cis-regulatory SNP can be used as biomarker for feed efficiency in Nelore cattle.
Palavras-Chave:  Cofatores de transcrição; Expressão gênica; Fatores de transcrição; Loci de característica quantitativa; Nelore cattle; Polimorfismos de nucleotídeo único.
Thesagro:  Gado Nelore.
Thesaurus Nal:  Gene expression; Quantitative trait loci; Single nucleotide polymorphism; Transcription (genetics); Transcription factors.
Categoria do assunto:  --
G Melhoramento Genético
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPTIA21230 - 1UPCAP - DD
CPPSE25684 - 1UPCAP - DDPROCI-2022.00052CAR2022.00107
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1.Imagem marcado/desmarcadoDUARTE, M. de L. R.; POLTRONIERI, M. C.; CHU, E. Y.; OLIVEIRA, R. F. de; LEMOS, O. F. de; BENCHIMOL, R. L.; CONCEIÇÃO, H. E. O. da; SOUZA, G. F. de. A cultura da pimenta-do-reino. 2. ed. rev. e ampl. Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica; Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2006. 73 p. il. color. (Coleção plantar, 55).
Tipo: Autoria/Organização/Edição de Livros
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Unidades Centrais.
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2.Imagem marcado/desmarcadoNOGUEIRA, O. L.; CONCEICAO, H. E. O. da. Análise de crescimento de açaizeiros em áreas de várzea do estuário amazonico. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 35, n. 11, p. 2167-2173, nov. 2000.
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Unidades Centrais.
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3.Imagem marcado/desmarcadoSANTIAGO, E. J. A. de; PINTO, J. E. B. P.; GAVILANES, M. L.; LAMEIRA, O. A.; CONCEIÇÃO, H. E. O. da; CASTRO, E. M. de; COELHO, M. C. F. Aspectos da anatomia foliar da pimenta longa (Piper hispidinervium C.DC.) sob diferentes condições de cultivo. Revista Brasileira de Fisiologia Vegetal, v. 11, p. 103, 1999. Suplemento. Resumo apresentado no 7º Congresso Brasileiro de Fisiologia Vegetal.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.
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4.Imagem marcado/desmarcadoSANTIAGO, E. J. A. de; PINTO, J. E. B. P.; CASTRO, E. M. de; LAMEIRA, O. A.; CONCEIÇÃO, H. E. O. da; GAVILANES, M. L. Aspectos da anatomia foliar da pimenta-longa (Piper hispidinervum C.DC.) sob diferentes condições de luminosidade. Ciência e Agrotecnologia, Lavras, v. 25, n. 5, p. 1035-1042, 2001. il.
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.
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5.Imagem marcado/desmarcadoBOTELHO, M. do N.; ROCHA NETO, O. G. da; CONCEICAO, H. E. O. da. Aspectos ecofisiológicos da pimenta-do-reino sob diversos tutores vivos. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFPA, 3., 1992, Belém, PA. Anais... Belém, PA: UFPa: CNPq: Governo do Estado do Pará, 1992. p. 45.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.
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6.Imagem marcado/desmarcadoVIEIRA, A. J. D.; ROCHA NETO, O. G. da; CONCEICAO, H. E. O. da. Aspectos ecofisiológicos da pimenta-do-reino sob diversos tutores vivos. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFPA, 3., 1992, Belém, PA. Anais... Belém, PA: UFPa: CNPq: Governo do Estado do Pará, 1992. p. 43.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.
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7.Imagem marcado/desmarcadoVIEGAS, I. de J. M.; MEIRELLES, R. de O.; FRAZÃO, D. A. C.; CONCEIÇÃO, H. E. O. da. Avaliação da fertilidade de um latossolo amarelo textura média para o cultivo do açaizeiro no estado do Pará. Revista de Ciências Agrárias, Belém, PA, n. 52, p. 23-36, jul./dez. 2009.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 4
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.
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8.Imagem marcado/desmarcadoCONCEIÇÃO, H. E. O. da; OLIVA, M. A.; LOPES, N. F.; ROCHA NETO, O. G. da; ARNDT, E. Avaliação de clones de seringueira (Hevea brasiliensis Muell Arg.) visando a resistência à seca. I. Comportamento de clones de seringueira submetidos a "deficit" hídricos crescentes. In: SEMINÁRIO NACIONAL DA SERINGUEIRA, 4., 1984, Salvador. Resumo dos trabalhos. [S.l.]: SUDHEVEA/EMBRAPA/EMBRATER/Banco Econômico, [1984]. p. 43-44.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
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9.Imagem marcado/desmarcadoCONCEIÇÃO, H. E. O. da; OLIVA, M. A.; LOPES, N. F.; ROCHA NETO, O. G. da; ARNDT, E. Avaliação de clones de seringueira (Hevea brasiliensis Muell Arg.) visando a resistência à seca. II Comportamento de clones de seringueira sob "deficit" hídricos cíclicos. In: SEMINÁRIO NACIONAL DA SERINGUEIRA, 4., 1984, Salvador. Resumo dos trabalhos. [S.l.]: SUDHEVEA/EMBRAPA/EMBRATER/Banco Econômico, [1984]. p. 45-46.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
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10.Imagem marcado/desmarcadoCONCEIÇÃO, H. E. O. da; OLIVA, M. A.; LOPES, N. F.; RODRIGUES, J. J. do V.; ARNDT, E. Avaliação de clones de seringueira (Hevea brasiliensis Muell Arg.) visando a resistência à seca. III. Crescimento de clones de seringueira submetidos a dois regimes hídricos. In: SEMINÁRIO NACIONAL DA SERINGUEIRA, 4., 1984, Salvador. Resumo dos trabalhos. [S.l.]: SUDHEVEA/EMBRAPA/EMBRATER/Banco Econômico, [1984]. p. 41-42.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
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11.Imagem marcado/desmarcadoPINHEIRO, F. S. V.; PINHEIRO, E.; CONCEIÇÃO, H. E. O. da. Avaliação de clones poliplóides de seringueira (Hevea sp) da serie IAC. Belém, PA: FCAP, 1980. 9 p. Trabalho apresentado no III Seminário Nacional da Seringueira. Mimeografado. Não convencional.
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.
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12.Imagem marcado/desmarcadoPINHEIRO, F. S. V.; PINHEIRO, E.; CONCEIÇÃO, H. E. O. da. Avaliação de clones poliplóides de seringueira (Hevea sp.) da série IAC. In: SEMINÁRIO NACIONAL DA SERINGUEIRA, 3., 1980, Manaus. Anais... Brasília, DF: SUDHEVEA, 1980. v. 1. p. 349-364.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
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13.Imagem marcado/desmarcadoPEREIRA, E. O. L.; CONCEIÇÃO, H. E. O. da; DUARTE, M. de L. R.; ISHIZUKA, Y.; AGUIAR, M. V. Avaliação de cultivares de pimenta-do-reino em sistema de cultivo "semi-intensivo". In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA FCAP, 12.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 6., 2002, Belém, PA. A contribuição do profissional de Ciências Agrárias no uso e conservação da biodiversidade: anais. Belém, PA: FCAP: Embrapa Amazônia Oriental, 2002.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.
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14.Imagem marcado/desmarcadoFREITAS, R. do A.; CONCEICAO, H. E. O. da. Avaliação de diferentes concentrações de fluoreto de sódio em plantas de milho. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA CNPq/FCAP/EMBRAPA, 6., 1996, Belém, PA. Resumos. Belém, PA: FCAP, 1996. p. 143.
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.
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15.Imagem marcado/desmarcadoPEREIRA, E. O. L.; CONCEIÇÃO, H. E. O. da; DUARTE, M. de L. R.; ISHIZUKA, Y.; AGUIAR, M. V. Avaliação de espécies de Piper nativas como porta-enxerto de Piper nigrum. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA FCAP, 12.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 6., 2002, Belém, PA. A contribuição do profissional de Ciências Agrárias no uso e conservação da biodiversidade: anais. Belém, PA: FCAP: Embrapa Amazônia Oriental, 2002.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.
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16.Imagem marcado/desmarcadoVASCONCELOS, R. D. de; CONCEICAO, H. E. O. da. Avaliação de Piper aduncum e Piper hispidinervium como porta-enxerto de pimenteira-do-reino (Piper nigrum). In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFRA, 2.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL (AVALIAÇÃO-2004), 8., 2005, Belém, PA. Ciência e tecnologia com inclusão social: anais. Belém, PA: UFRA: Embrapa Amazônia Oriental, 2005. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.
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17.Imagem marcado/desmarcadoSOUSA, C. A. N. de; CONCEIÇÃO, H. E. O. da. Avaliação de porta-enxertos de Piper nativas tolerantes à fusariose. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA FCAP, 11.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL (AVALIAÇÃO-2001), 5., 2001, Belém, PA. Resumos. Belém, PA: FCAP: Embrapa Amazônia Oriental, 2002. p. 176.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.
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18.Imagem marcado/desmarcadoCONCEIÇÃO, H. E. O. da; QUADROS, B. R. de; VASCONCELOS, R. D. de; GONÇALVES, M. F.; SILVA, E. S. A. Avaliação de sensibilidade de plantas ao fluoreto atmosférico. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE ENGENHARIA AGRÍCOLA, 3., 2004, Brasília, DF. Anais. Brasília, DF: Universidade Católica de Brasília, 2004.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.
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19.Imagem marcado/desmarcadoVIEGAS, I. de J. M.; FRAZÃO, D. A. C.; CONCEIÇÃO, H. E. O. da; SOUSA, G. O. Avaliação do efeito da adubação mineral em plantas de cupuaçuzeiro na fase de produção. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 19., 2006, Cabo Frio. Frutas do Brasil: saúde para o mundo: palestras e resumos. Cabo Frio: Sociedade Brasileira de Fruticultura; Campos dos Goytacazes: Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro, 2006. p. 532.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.
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20.Imagem marcado/desmarcadoCONCEIÇÃO, H. E. O. da. Avaliação do uso de herbicidas em viveiro de seringueira (Hevea sp). In: SEMINÁRIO NACIONAL DA SERINGUEIRA, 4., 1984, Salvador. Resumo dos trabalhos. [S.l.]: SUDHEVEA/EMBRAPA/EMBRATER/Banco Econômico, [1984]. p. 84.
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